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1、提高土壤肥力。
土壤中95%的微量元素以不溶性形式存在，不能被植物吸收利用。然而，微生物代谢产物含有大量的有机酸。这些物质就像冰块中加入的热水一样，能迅速溶解植物必需的钙、镁、硫、铜、锌、铁、硼、钼等微量元素和其他矿质元素，成为植物可以直接吸收利用的营养元素，从而大大增加土壤的供肥能力。
有机肥中的有机质增加了土壤中有机质的含量，使土壤粘聚度降低，沙土的保水保肥性能变强，使土壤形成稳定的团粒结构，能很好地起到协调供应肥力的作用。使用有机肥后，土壤会变得疏松肥沃。
2.改善土壤质量，促进土壤微生物的繁殖
有机肥能使土壤中的微生物大量繁殖，尤其是许多有益微生物，如固氮菌、氨化菌、纤维素分解菌等。这些有益微生物可以分解土壤中的有机质，增加土壤的团粒结构，改善土壤成分。
微生物在土壤中繁殖非常快。它们就像一张看不见的网，错综复杂。微生物细胞死亡后，土壤中会留下许多细小的管道。这些细小的管道不仅增加了土壤的透气性，而且使土壤蓬松柔软，养分和水分不易流失，从而增加了土壤蓄水保肥能力，避免和消除了土壤板结。
有机肥中的有益微生物还可以抑制有害细菌的繁殖，这样可以少用农药。如果多年施用，能有效抑制土壤害虫，省工、省钱、无污染。
同时，有机肥含有动物消化道分泌的各种活性酶和微生物产生的各种酶。这些物质施入土壤后，可以大大提高土壤的酶活性。长期施用有机肥可以改善土壤质量。如果从根本上改善土壤质量，就不怕结不出优质水果。
3.提供作物所需的全方位营养，保护作物的根和茎。
有机肥含有大量植物所需的营养物质、微量元素、糖类和脂肪。
有机肥分解释放的CO2可以作为光合作用的物质。有机肥还含有5%的氮、磷、钾，45%的有机质，能为作物提供全面的营养。
同时不得不提的是，有机肥在土壤中分解，可以转化成各种腐植酸。它是一种对重金属离子具有良好络合和吸附性能的高分子物质，能有效降低重金属离子对作物的毒害，阻止其进入植物体内，保护腐殖质的根茎。
4.增强作物的抗病、抗旱、耐涝能力。
有机肥含有维生素、抗生素等。，可以增强作物抵抗力，减少或预防病害。有机肥施入土壤后，可以增强土壤的蓄水保水能力，在干旱条件下，可以增强作物的抗旱能力。
同时，有机肥还能疏松土壤，改善作物根系生态环境，促进根系生长，增强根系活力，提高作物耐涝性，降低植物死亡率，提高农产品成活率。
5.提高食品的安全性和绿色性。
国家早就规定，农业生产过程中必须限制无机肥料的过量使用，有机肥是生产绿色食品的主要肥料来源。由于有机肥中的各种营养元素比较齐全，而且这些物质完全是无毒、无害、无污染的天然物质，这就为生产高产、优质、无公害的绿色食品提供了必要的条件。上面提到的腐植酸可以减少重金属离子对植物的伤害，相当于减少了重金属对人体的伤害。
6.增加作物产量
有机肥中的有益微生物利用土壤中的有机质产生次生代谢产物，其中含有大量的促生长物质。如生长素能促进植物伸长生长，脱落酸能促进果实成熟，赤霉素能促进开花坐果，增加开花数、坐果率，增加产量，使果实丰满、色泽鲜亮，提前上市，增产增收。
7.减少养分流失，提高肥料利用率
化肥的实际利用率只有30%~45%。流失的肥料有的分解释放到大气中，有的随水土流失流失，有的固定在土壤中，不能被植物直接吸收利用。
施用有机肥后，有益的生物活动改善了土壤结构，提高了土壤保水保肥能力，从而减少了养分流失。添加有益微生物分解磷、钾，可使化肥的有效利用率提高到50%以上。
有机肥的优势表明它是不可替代的。相比化肥，以后人们会选择有机肥，化肥的用量会越来越少！
