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1.脐腐病：主要表现果实脐部出现深褐色或黑色的病斑。主要原因是土壤缺钙或土壤盐分过高、水分供应失调，影响钙的吸收造成。
预防措施：一是合理施用肥水，实行平衡施肥，防止土壤次生盐渍化，尤其是结果期应保证水份均衡供应。二是在初花期开始用l%的过磷酸钙或0.5%氯化钙，加5ppm萘乙酸叶面喷施，10～15天1次，连喷2～3次。
2.空洞果：主要表现为果实内部果肉不充实，有空洞形成。坐果前使用激素过量、光照不足或日高温超过35℃以上时间较长，中后期肥料供应不足，浇水过量或不足等原因，均易形成空洞果。
预防措施：一是搞好光温调节，增加光照，避免35℃以上高温的影响，当高温天气出现时，应及早通风或遮阳降温。二是及时供应肥水，促进植株健壮生长。增施有机肥，合理施用氮磷钾及微量元素化肥。三是正确使用激素，在蘸花时应严格掌握激素浓度，并根据温度变化适当增减。
3.裂果：主要表现果皮出现裂纹。在果实发育后或转色期遇到高温、烈日、干旱、暴雨等不良气候条件时，特别是干旱和果肉生长速度不同步时则出现裂果。另外，浇水过大或暴雨过后导致根系生理障碍及对硼的吸收受阻时也易产生裂果。
预防措施：一是保证肥水均衡供应。二是搞好温光调控避免温度过高。三是坐果初期用0.1%硫酸锌和0.1%硫酸铜溶液喷洒植株和幼果，提高抗热和抗裂能力。果实发育后期用27%高脂膜乳剂80～倍液喷洒果实。
4.畸形果：主要表现果实脐部突出或凹陷，果形多棱或盘形。当幼苗期遇到低温、干旱或氮肥过多时多出现果实畸形，当蘸花使用激素过量时多出现脐部突出。一般连阴天气较多和低温年份畸形果较多。
预防措施：一是调节好光、温、肥、水，满足番茄生长发育的要求，促进花芽正常分化。二是喷施0.01%助壮素控制植株徒长。三是严格掌握蘸花时的激素浓度，防止浓度过高。
科学管理甜椒，严防畸形果！
畸形果是甜椒生长过程中发生较多的问题之一，主要表现为果实生长不正常，长得个头小，果形扁圆像柿饼或蟠桃，里面无种子或种子发育不良。
一、原因
1、温度。温度管理非常重要，低温时期要注意避免气温及地温过低，影响甜椒开花授粉坐果，尽可能将棚室温度白天控制25~28℃，夜间控制在13~18℃.这样就能有效防止温度过高或过低造成甜椒畸形现象。
2、缺乏硼肥。甜椒会开花坐果不良，容易出现畸形果，因此要在开花前后注意喷洒含有硼的叶面肥如叶面喷洒硼砂等。同时，甜椒进入结果期后，需求钾肥的量加大，约为氮肥的2.5倍左右，因而在施肥时一定要增加钾肥的使用，避免过量使用氮肥出现畸形果。
3、注意控制植株长势。植株生长过旺，出现畸形果的几率会增大，可通过喷洒生长调节剂或进行整枝打杈等方式保证甜椒果实的正常生长。如果甜椒坐不住果，可能会导致植株生长过旺，可喷洒促花王3号以及通过温度调控来保证植株的正常长势，以利于果实生长。
4、植株营养生长过剩，则生殖生长不足，易出现畸形果。若植株营养生长过旺，在合理调控棚室温湿度的前提下可喷施助壮素倍或矮壮素倍进行控制。
二、防治
1、注意温度控制：秋季在甜椒开花坐果时，温度不宜过高，如果大棚内的温度超过35℃：或者是32℃连续2小时以上，甜椒就会出现授粉或受精不良的情况。春节前后要注意避免大棚内的气温及地温过低，影响甜椒坐果，冲施沃达丰菌物生态复合肥及丰产宝等生物肥，可促进甜椒正常坐果。
2、注意补肥。甜椒缺乏硼、钙等元素会导致畸形果，要经常注意喷洒含有硼、钙等元素的叶面肥或营养平衡剂，如叶面喷洒绿芬威3号以及硼酸或硼砂等。减少氮肥的施用量，增加钾肥，如磷酸二氢钾、硫酸钾等的施用量，及时喷洒甲壳丰或海力等营养平衡剂，有利于坐果。
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